교무처는 교원·강사 채용 및 인사 업무 등을 담당하는 교무팀과 대학 학생정원조정 및 학적, 수업, 성적관리 업무를 담당하는 학사지원팀, 입학전형 기획 및 운영 등을 담당하는 입학관리본부로 나뉘어져 있다.
서울캠퍼스 산학협력단은 “산업교육진흥 및 산학협력 촉진에 관한 법률”에 의거 2004년 3월 17일 홍익대학교 내에 설립된 특수한 성격의 법인으로서 산학협력팀과 창업교육센터를 두고 있으며, 부설 연구기관으로는 첨단교통연구센터, 로봇윤리와 법제연구센터, 융합예술연구센터 및 MR미디어 아트텍센터가 있다.
세종캠퍼스 산학협력단은 “산업교육진흥 및 산학협력 촉진에 관한 법률”에 의거 2012년 1월 3일 홍익대학교 세종캠퍼스 내에 설립된 법인으로서 산학협력팀과 창업교육센터, 벤처기업창업보육센터를 두고 있다.